殺菌滅藻劑主要分為以下幾類：

1. 氧化性殺菌滅藻劑

• 氯氣：是使用量較大的殺菌劑，但易產生，使用受限。

• 二氧化氯：殺菌能力強，適合 pH 范圍廣，還具有剝離性能，不過沸點低，運輸和使用不便。

• 次氯酸鈉：殺生作用較好，但與氯氣有類似缺點，受一定限制。

• 氯胺：殺菌持續時間長，能抑制微生物后期生長，但殺菌能力差且價格昂貴。

• 臭氧：作用快、污染小，但氧化能力過強，對設備要求高且成本過高。

• 溴基殺菌劑：相對較新，市場占有量增長平穩，但在含有機磷鹽的水中不宜使用且價格昂貴。

• 過氧化物：不會形成有害分解產物，但可被過氧化物酶分解。

2. 非氧化性殺菌滅藻劑

• 季銨鹽類：如十二烷基二等，低毒、高效，殺菌同時兼具剝離、緩蝕等多種功能，應用廣泛。

• 異噻唑啉酮：廣譜性殺菌劑，對粘泥有剝離作用，投藥時間間隔長且不起泡沫。

• 有機硫化合物：如二硫氰基甲烷等，對硫酸鹽還原菌有效，低毒、易溶于水。

• 銅鹽：銅離子能凝結菌體膠質物質，破壞細胞呼吸和代謝作用，常用于持久殺菌場合，但對水生生物毒性大，排放易造成環境污染。

3. 其他類型

• 戊二醛：幾乎無毒，耐高溫，是殺硫酸鹽還原菌的，本身可生物降解，但會與銨鹽化合物反應失去活性。

• 季磷鹽：新型殺菌劑，與季銨鹽結構相似，纏繞微生物能力強，提高了殺生性能，高效、廣譜、低毒、易生物降解。